अफ्रीका की बड़ी नदियाँ और झीलें महाद्वीप के लिए बहुत महत्वपूर्ण भूमिका निभाती हैं, क्योंकि इनका उपयोग पानी और सिंचाई के लिए किया जाता है। बड़ी नदियों पर कई जलाशय बनाए गए हैं, जिनकी कुल मात्रा पंद्रह घन किलोमीटर से अधिक है। उनमें से सबसे बड़े नासिर, करिबा और वोल्टा जैसे हैं। अधिकांश बड़ी झीलें पूर्वी अफ्रीकी पठार पर स्थित हैं और इनमें काफी गहराई है। उदाहरण के लिए, पूरे ग्रह पर इस सूचक में तांगानिका बैकाल के बाद दूसरे स्थान पर है। इसका सबसे गहरा बिंदु पानी की सतह से 1470 मीटर की दूरी पर है। महाद्वीप की सबसे बड़ी झील विक्टोरिया है।
रेटिंग "अफ्रीका की सबसे बड़ी नदियाँ" जिसका नेतृत्व नील नदी करता है। इसकी कुल लंबाई 6671 किमी है। यह कागेरा नदी के रूप में शुरू होती है और कई झीलों से गुजरते हुए सफेद नील नदी के नाम से उनमें से निकलती है। इसके अलावा, खार्तूम शहर के पास, ब्लू नाइल इसमें बहती है, जो इथियोपियाई हाइलैंड्स में स्थित टाना झील से निकलती है। अफ्रीका की ये बड़ी नदियाँ एक पूरे में शामिल होकर एक बहुत विस्तृत मार्ग बनाती हैं, जिसे नील कहा जाता है।इसके ऊपरी भाग में बड़ी संख्या में झीलें, झरने और रैपिड्स हैं। मैदान पर कई सहायक नदियाँ और शाखाएँ दिखाई देती हैं, और इसलिए घाटी काफी दलदली हो जाती है। दलदलों के पीछे, नीचे की ओर, किनारों के साथ, पेड़ों की संकरी पट्टियों से एक प्रकार का हरा गलियारा बनता है। पीले रेगिस्तान की पृष्ठभूमि के खिलाफ, यह काफी विपरीत दिखता है।
नदी का एक महत्वपूर्ण हिस्सा पानी रहित रेगिस्तान से घिरा हुआ है। इसके बावजूद, नील नदी हमेशा भरी रहती है, खासकर गर्मियों और शरद ऋतु में। अफ्रीका की अन्य प्रमुख नदियों की तरह कृषि के लिए भी इसका बहुत महत्व है। तथ्य यह है कि पानी के घटने के बाद गाद की एक परत रह जाती है, जो पृथ्वी को खाद देती है। इससे आप अच्छी पैदावार प्राप्त कर सकते हैं। यह आश्चर्य की बात नहीं है कि नील घाटी कई सहस्राब्दियों पहले मानव जाति का वास्तविक पालना बन गई थी। उनके लिए धन्यवाद, यह आधुनिक मिस्र के क्षेत्र में था कि कृषि पहली बार दिखाई दी और ग्रह पर पहले शक्तिशाली राज्यों में से एक का गठन किया गया।
"अफ्रीका की प्रमुख नदियों" की सूची में दूसरे स्थान पर 4320 किमी लंबी कांगो है। इसे पूरे पूर्वी गोलार्ध में सबसे प्रचुर मात्रा में माना जाता है। नदी के प्रवाह के साथ, महाद्वीप के दक्षिणी और उत्तरी क्षेत्रों की कई सहायक नदियाँ इससे जुड़ी हैं। मार्च से नवंबर की अवधि में, कांगो को मुख्य रूप से दाहिनी सहायक नदियों द्वारा और सितंबर से मार्च तक - बाईं सहायक नदियों द्वारा खिलाया जाता है। इसके लिए स्पष्टीकरण काफी सरल है: तथ्य यह है कि मुख्य भूमि के विभिन्न गोलार्धों में बारिश का मौसम अलग-अलग समय पर पड़ता है। यह बारीकियां सकारात्मक भूमिका निभाती हैं, क्योंकि उन्हीं की बदौलत नदी पूरे साल भर बहती रहती है।
जब कांगो अटलांटिक महासागर में बहता है, तो एक विशाल मुहाना बनता है, इसलिए इसका पानी नदी में (17 किलोमीटर तक) बहुत गहरा हो जाता है। इसके प्रभाव से समुद्र का सतही जल मुंह से लगभग 75 किलोमीटर की दूरी पर ताजा रहता है। कांगो के पानी का रंग पहले भूरा और फिर पीला होता है। यह समुद्र तट से तीन सौ किलोमीटर दूर भी नीले समुद्र के पानी के खिलाफ खड़ा है।
अफ्रीका की अन्य प्रमुख नदियाँ नाइजर (4160 किमी), ज़ाम्बेज़ी (2660 किमी) और ऑरेंज नदी (1860 किमी) हैं।
